Gökhan Çetinsaya (d. 10 Mayıs 1964) 6 Kasım 2014 tarihinden itibaren Başbakan Başmüşavirliği görevini yürüten, eski Yükseköğretim Kurulu Başkanı, Türk siyaset bilimci ve akademisyen.
1964 yılında İstanbul'da doğan Çetinsaya, Beşiktaş Atatürk Anadolu Lisesi sonrası Ankara Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi'nden 1985'te mezun oldu.[1] Yüksek lisansını aynı fakültede 1988 yılında tamamladı.[1] Daha sonraManchester Üniversitesi Orta Doğu Araştırmaları Bölümünden doktora unvanını aldı.[1] 1995 ve 2001 yılları arasında Hacettepe Üniversitesi'nde önce yardımcı doçent sıfatıyla, daha sonra doçent sıfatıyla Kamu Yönetimi Bölümü 'nde görev yaptı.[1] Ardından İstanbul Teknik Üniversitesi'ne geçerek İnsan ve Toplum Bilimleri Bölümü'nde dersler verdi.[1] 2005 yılında burada profesör oldu.[1]
Çetinsaya, 2008 yılında kurulan İstanbul Şehir Üniversitesi'nin rektörlük görevini üstlendi.[1] 11 Aralık 2011'de Yusuf Ziya Özcan'ın görev süresinin sona ermesiyle Cumhurbaşkanı Abdullah Gül tarafından Yükseköğretim Kurulu üyeliği ve başkanlığına atandı.[2] Ertesi gün görevi Özcan'dan devraldı.[3] 6 Kasım 2014 tarihinde Başbakan Başmüşavirliğine atanmış ve Büyükelçi unvanı verilmiştir.[4]
Gökhan Çetinsaya evli ve 2 çocuk babasıdır.[1]